В результате выделения бактериями, находящимися в кариозной полости, кислот и протеолитических ферментов происходит разрушение поверхностных слоев дентина. Эту зону называют зоной деструкции. Под ней расположена зона пенетрации, так как дентинные канальцы этой области обсеменены микроорганизмами. Вокруг расположена зона деминерализации, в которую еще не проникли бактерии. Когда процесс прогрессирует быстро, может образоваться так называемый мертвый путь. В нем произошло разрушение отростков одонтобластов без развития тубулярного склероза.
Такие тубулы обсеменяются бактериями и сливаются, формируя очаг размягчения. Деструкция также может продвигаться по линиям роста, которые идут под углом к дентинным канальцам, что приводит к образованию поперечных трещин.
В ответ на деструктивные процессы все еще происходит развитие тубулярного склероза и образование третичного дентина. Оба процесса приводят к снижению проницаемости дентина, несмотря на то что степень минерализации третичного дентина н иже по сравнению с первичным и вторичным и состоит из иррегулярно расположенных дентинных канальцев. Даже на такой поздней стадии удаление инфицированных тканей и/или наложение пломбировочного материала и, как следствие, появление у пациента возможности очищения зуба приводит к стабилизации процесса и поддержанию репаративных процессов. Даже если произошло образование мертвого пути и погибли одонтобласты, возможно образование новых клеток из фибробластов нижележащих слоев пульпы с последующим построением нового дентина. Он называется заместительным дентином. Продолжение деструктивных процессов в дентине может привести к началу воспаления пульпы.